RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635963.1

EFHC1-211, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EFHC1, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-211ENST00000635963 TRIM29Q14134 588 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 DUSP6Q16828 381 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 XKR9Q5GH70 373 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 GJD3Q8N144 294 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 LPPQ93052 612 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 C8orf76Q96K31 380 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ZNF558Q96NG5 402 aa14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ARL2P36404 184 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TXKP42681 527 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 PTENP60484 403 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 POU5F1BQ06416 359 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 AMHR2Q16671 573 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TPH2Q8IWU9 490 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 RNF169Q8NCN4 708 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TCP11Q8WWU5 503 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 MTRQ99707 1265 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 IGFLR1Q9H665 355 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 CD207Q9UJ71 328 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 INPPL1O15357 1258 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ASAP2O43150 1006 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 MARCH6O60337 910 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 OFD1O75665 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 DGAT1O75907 488 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SKIP12755 728 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 MCM7P33993 719 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 CAPSQ13938 189 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 CLUL1Q15846 466 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 ABI1Q8IZP0 508 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 RNF149Q8NC42 400 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 SPG21Q9NZD8 308 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 FAM50BQ9Y247 325 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-211ENST00000635963 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 FSD2A1L4K1 749 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 HIDE1A8MVS5 230 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TSPAN1O60635 241 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MED24O75448 989 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 GLRA2P23416 452 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NDUFV1P49821 464 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 BCAR1P56945 870 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SUSD6Q92537 303 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TCF25Q9BQ70 676 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TLE6Q9H808 572 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PER2O15055 1255 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 OR52Z1P0C646 297 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 COL9A1P20849 921 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TRAPPC10P48553 1259 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms