RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 OGFRQ9NZT2 677 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.87■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TTC26A0AVF1 554 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ZEB2O60315 1214 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 DGAT1O75907 488 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 INSRRP14616 1297 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KCNA10Q16322 511 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC7Q99615 494 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.86■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KPNA6O60684 536 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 HIP1RO75146 1068 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PSEN2P49810 448 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CBX1P83916 185 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MFSD10Q14728 455 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RNF180Q86T96 592 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 HPS3Q969F9 1004 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 NUP58Q9BVL2 599 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ASGR1P07306 291 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CCL5P13501 91 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SOX10P56693 466 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 IGBP1P78318 339 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 COASYQ13057 564 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 LRRC41Q15345 812 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CENPPQ6IPU0 288 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 DAW1Q8N136 415 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RETREG2Q8NC44 543 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 HAS3O00219 553 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 FAM13AO94988 1023 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MAPK7Q13164 816 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PSMD2Q13200 908 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 EMC2Q15006 297 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RNF208Q9H0X6 261 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 RFC5P40937 340 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 PPME1Q9Y570 386 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN8-208ENST00000635751 A0A0U1RQJ8 604 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 EHHADHQ08426 723 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PPFIA1Q13136 1202 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MYCT1Q8N699 235 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 DEFB118Q96PH6 123 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TIPINQ9BVW5 301 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SETD4Q9NVD3 440 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.83■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 COL1A2P08123 1366 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TUBB2AQ13885 445 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 GRIK4Q16099 956 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SFR1Q86XK3 245 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TMEM143Q96AN5 459 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PARVGQ9HBI0 331 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms