RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-220	ENST00000618056	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	RAB27A	P51159	221 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	GPM6B	Q13491	265 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF623	O75123	536 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	PPM1E	Q8WY54	764 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	SLC26A4	O43511	780 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	ERLIN2	O94905	339 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	P2RX5	Q93086	422 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	VCAN	P13611	3396 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056		E9PMD0	336 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	AXL	P30530	894 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	CASD1	Q96PB1	797 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PMS1-220	ENST00000618056	TSPAN1	O60635	241 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PTPA	Q15257	358 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PTPRO	Q16827	1216 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	KCNK18	Q7Z418	384 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	RNF169	Q8NCN4	708 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PNMA5	Q96PV4	448 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CLIC4	Q9Y696	253 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	AMHR2	Q16671	573 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	ABI1	Q8IZP0	508 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	BSND	Q8WZ55	320 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	KIFAP3	Q92845	792 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CCDC51	Q96ER9	411 aa		27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		27.56	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		27.56	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	NAMPT	P43490	491 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PPP2R5A	Q15172	486 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	UBXN11	Q5T124	520 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CABP7	Q86V35	215 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LRRC43	Q8N309	656 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CWH43	Q9H720	699 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	AAAS	Q9NRG9	546 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		27.55	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	NOTUM	Q6P988	496 aa		27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		27.54	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	UBA7	P41226	1012 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	GRIN1	Q05586	938 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	FAM187B	Q17R55	369 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PGBD4	Q96DM1	585 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	IFT74	Q96LB3	600 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	FZD8	Q9H461	694 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		27.53	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	GRM6	O15303	877 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LAG3	P18627	525 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CNNM3	Q8NE01	707 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	LPP	Q93052	612 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	CALML4	Q96GE6	196 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		27.52	■■■□□ 2
PMS1-220	ENST00000618056	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		27.52	■■■□□ 2

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