RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	STX2	P32856	288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC77	Q9BR77	488 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MME	P08473	750 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MFAP3	P55082	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	DLG4	P78352	724 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	BFSP1	Q12934	665 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TRPC3	Q13507	836 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449		M0R2N6	131 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GAS8	O95995	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	COMT	P21964	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NOL4	O94818	638 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SGPL1	O95470	568 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	GPC5	P78333	572 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ECEL1	O95672	775 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ATF2	P15336	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CUL1	Q13616	776 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TMED2	Q15363	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC188	H7C350	402 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	NID2	Q14112	1375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SLITRK3	O94933	977 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	FLT3	P36888	993 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	PMS2	P54278	862 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ACSS3-208	ENST00000616449	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	MTMR2	Q13614	643 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	RASA3	Q14644	834 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ACSS3-208	ENST00000616449	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.71	□□□□□ -0.22

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