RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TRAPPC3O43617 180 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 EFHC2Q5JST6 749 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RNF217Q8TC41 542 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 HACD3Q9P035 362 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 LAMC1P11047 1609 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PRKCBP05771 671 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ATP1A3P13637 1013 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SP110Q9HB58 689 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SESN3P58005 492 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PSMD14O00487 310 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 NME3Q13232 169 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 STYK1Q6J9G0 422 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ARL4CP56559 192 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN26Q16670 478 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GGPS1O95749 300 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GH1P01241 217 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MGEA5O60502 916 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 BARGINQ6ZT62 677 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 WHAMMQ8TF30 809 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PGBD4Q96DM1 585 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC53A6NM62 1247 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 EYA4O95677 639 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.52■■□□□ 1.04
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CTDP1-208ENST00000613122 SNX2O60749 519 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RAD51Q06609 339 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TNIP3Q96KP6 325 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ASIC4Q96FT7 647 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K7O43318 606 aa21.52■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 PALMO75781 387 aa21.52■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CYP2B6P20813 491 aa21.52■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC188H7C350 402 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 OPHN1O60890 802 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 FAM151AQ8WW52 585 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 KRT37O76014 449 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ATG16L1Q676U5 607 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 SPON2Q9BUD6 331 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 TIPINQ9BVW5 301 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 NYAP2Q9P242 653 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF543Q08ER8 600 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 NUP85Q9BW27 656 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFB10O96000 172 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 MYBL1P10243 752 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CETPP11597 493 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 XKR3Q5GH77 459 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 PP2D1A8MPX8 630 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CUL1Q13616 776 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 DYRK4Q9NR20 520 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-208ENST00000613122 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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