RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 BACH1O14867 736 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 LYPLA2O95372 231 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GLP2RO95838 553 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 NRIP1P48552 1158 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS13AQ96RL7 3174 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 LGALS2P05162 132 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GNAT1P11488 350 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 STAT5BP51692 787 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf19Q8IY42 314 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DYDC2Q96IM9 177 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM167AQ96KS9 214 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 LXNQ9BS40 222 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GABBR1Q9UBS5 961 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PP2D1A8MPX8 630 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ENPP3O14638 875 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 DGKIO75912 1065 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SLITRK3O94933 977 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGB1P05556 798 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SUSD6Q92537 303 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 EPSTI1Q96J88 318 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNA1BQ00975 2339 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 MED24O75448 989 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM4P33991 863 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SPECC1Q5M775 1068 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FSIP1Q8NA03 581 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 GLG1Q92896 1179 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PCYT2Q99447 389 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RGL1Q9NZL6 768 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 USP25Q9UHP3 1055 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 HPSEQ9Y251 543 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC3P53804 2025 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC25AP30304 524 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP4A11Q02928 519 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TPH2Q8IWU9 490 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 NACC1Q96RE7 527 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CUEDC2Q9H467 287 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 SETD4Q9NVD3 440 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 STK17AQ9UEE5 414 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PFKFB1P16118 471 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 XKR3Q5GH77 459 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 USP49Q70CQ1 688 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 POF1BQ8WVV4 589 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRNA1P02708 482 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB33Q86T24 672 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ADSSL1Q8N142 457 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 TLE6Q9H808 572 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PPME1Q9Y570 386 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF292O60281 2723 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 OATP04181 439 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 GHRP10912 638 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM17P78536 824 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCEQ02156 737 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 UGCGQ16739 394 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 IQUBQ8NA54 791 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 PNMA5Q96PV4 448 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 DNM3Q9UQ16 869 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GVL5 298 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF862O60290 1169 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCG1P19174 1290 aa26.2■■□□□ 1.78
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