RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-209ENST00000591387 IGFLR1Q9H665 355 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-209ENST00000591387 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTIF-209ENST00000591387 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-209ENST00000591387 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-209ENST00000591387 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-209ENST00000591387 IL9P15248 144 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 KRT17Q04695 432 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 TFDP1Q14186 410 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 RNF149Q8NC42 400 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 HELQQ8TDG4 1101 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 PGBD4Q96DM1 585 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 HCSTQ9UBK5 93 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 KIF3AQ9Y496 699 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 POTEMA6NI47 508 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CSPG5O95196 566 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 OR52Z1P0C646 297 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 RARRES1P49788 294 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ERMNQ8TAM6 284 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 TLE6Q9H808 572 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 SPG21Q9NZD8 308 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 FSCN2O14926 492 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 AXLP30530 894 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.88e-7■■■■□ 24.7
CTIF-209ENST00000591387 PTENP60484 403 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ZNF174Q15697 407 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 TTC38Q5R3I4 469 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CNNM3Q8NE01 707 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NACC1Q96RE7 527 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ERLIN2O94905 339 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MUTP22033 750 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ARL2P36404 184 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 TECP42680 631 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NRIP1P48552 1158 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NDUFV1P49821 464 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ERVFC1P60507 584 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 GJD3Q8N144 294 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CCDC51Q96ER9 411 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CD207Q9UJ71 328 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 TBX10O75333 385 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 RPA1P27694 616 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 LINC01565O15544 149 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MBTPS2O43462 519 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 OFD1O75665 1012 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 EYA4O95677 639 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MCM2P49736 904 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 BCAR1P56945 870 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 COASYQ13057 564 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 DUSP6Q16828 381 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 LPPQ93052 612 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 TCF25Q9BQ70 676 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 STK24Q9Y6E0 443 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-209ENST00000591387 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 MED24O75448 989 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 CAPSQ13938 189 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 UBXN11Q5T124 520 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 NOTUMQ6P988 496 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-209ENST00000591387 URGCPQ8TCY9 931 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms