RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 CA8P35219 290 aa20.51■□□□□ 0.87
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CIRBP-232ENST00000591376 KCNC3Q14003 757 aa20.51■□□□□ 0.87
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CIRBP-232ENST00000591376 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.5■□□□□ 0.87
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CIRBP-232ENST00000591376 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.48■□□□□ 0.87
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CIRBP-232ENST00000591376 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.47■□□□□ 0.87
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CIRBP-232ENST00000591376 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.46■□□□□ 0.87
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CIRBP-232ENST00000591376 BTBD18B2RXH4 712 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 SLITRK3O94933 977 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 GALTP07902 379 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 NEK4P51957 841 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 TRIM29Q14134 588 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.45■□□□□ 0.86
CIRBP-232ENST00000591376 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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