RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	PGBD4	Q96DM1	585 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	C8orf76	Q96K31	380 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	PER2	O15055	1255 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	SLITRK3	O94933	977 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ALAD	P13716	330 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	GUCY1B3	Q02153	619 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	LONRF3	Q496Y0	759 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	TMC7	Q7Z402	723 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	TCF25	Q9BQ70	676 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	CARNS1	A5YM72	827 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	CA8	P35219	290 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	PBX3	P40426	434 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	RNF149	Q8NC42	400 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBTB39	O15060	712 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	MCM7	P33993	719 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ZP2	Q05996	745 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	TFDP1	Q14186	410 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	FERMT3	Q86UX7	667 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	LPP	Q93052	612 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM169	Q96HH4	297 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ERLIN2	O94905	339 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	32.88	■■■□□ 2.85	4e-7	■■□□□ 11.8
SMAD2-208	ENST00000587269	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	FSCN2	O14926	492 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF623	O75123	536 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	BCAR1	P56945	870 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	DUSP6	Q16828	381 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	URGCP	Q8TCY9	931 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	CLEC1B	Q9P126	229 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	DGAT1	O75907	488 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	LYPLA2	O95372	231 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	COASY	Q13057	564 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	EYA4	O95677	639 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	MTMR9	Q96QG7	549 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	GPR37L1	O60883	481 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	ST3GAL1	Q11201	340 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	ERMN	Q8TAM6	284 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	GBP3	Q9H0R5	595 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	DCX	O43602	365 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	OFD1	O75665	1012 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	GLP2R	O95838	553 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	AXL	P30530	894 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF174	Q15697	407 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	CNNM3	Q8NE01	707 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	POTEM	A6NI47	508 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	HIDE1	A8MVS5	230 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	WNT7A	O00755	349 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	CXCL14	O95715	111 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TEC	P42680	631 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	RSAD1	Q9HA92	442 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD2-208	ENST00000587269	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		32.81	■■■□□ 2.84

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