RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ENPP3	O14638	875 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CMA1	P23946	247 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PBX2	P40425	430 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	NPTX2	P47972	431 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	KCNJ6	P48051	423 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DHX58	Q96C10	678 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	B4GALT5	O43286	388 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	GJB5	O95377	273 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	AMH	P03971	560 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PLS3	P13797	630 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	RABGGTB	P53611	331 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PEX3	P56589	373 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ADAM2	Q99965	735 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FZD8	Q9H461	694 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538		A0A1B0GVL5	298 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DNAJB2	P25686	324 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	NDUFA8	P51970	172 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FAM189B	P81408	668 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31	1e-10	■■■■□ 20.8
USP22-211	ENST00000584538	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DDX12P	Q92771	950 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PRKCB	P05771	671 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	MYOG	P15173	224 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	STAM	Q92783	540 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP22-211	ENST00000584538	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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