RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 PTGDRQ13258 359 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TFDP1Q14186 410 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 FERMT3Q86UX7 667 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 P2RX5Q93086 422 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 NACC1Q96RE7 527 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 RAB34Q9BZG1 259 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 IGFLR1Q9H665 355 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 MED24O75448 989 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 EOMESO95936 686 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB1P05556 798 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00271P0C7V0 271 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 TIE1P35590 1138 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 HELQQ8TDG4 1101 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 POF1BQ8WVV4 589 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PGBD4Q96DM1 585 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CASD1Q96PB1 797 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 BACH2Q9BYV9 841 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF558Q96NG5 402 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CLDND1Q9NY35 253 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 HCSTQ9UBK5 93 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf42Q9H799 3197 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 CA8P35219 290 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 PTENP60484 403 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 UBE3AQ05086 875 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 KRT79Q5XKE5 535 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 NOTUMQ6P988 496 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 PADI6Q6TGC4 694 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.23□□□□□ -0.93
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