RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	EDA	Q92838	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GAA	P10253	952 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	COMT	P21964	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SOX5	P35711	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	BPIFB4	P59827	614 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	USP7	Q93009	1102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GPR20	Q99678	358 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ADGRL1	O94910	1474 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	MATN3	O15232	486 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	KDM1A	O60341	852 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TOX4	O94842	621 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CD69	Q07108	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	STAT4	Q14765	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GRM7	Q14831	915 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TTC1	Q99614	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	LY86	O95711	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GPR15	P49685	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SESN3	P58005	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PR48	441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	MUSK	O15146	869 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	MTSS1	O43312	755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	FSBP	O95073	299 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CT83	Q5H943	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COX11-208	ENST00000576084	KDM6B	O15054	1643 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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