RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 TNK2Q07912 1038 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SIGLEC14Q08ET2 396 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CAVIN4Q5BKX8 364 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PHC3Q8NDX5 983 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2FQ969M7 185 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 FAM50BQ9Y247 325 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01553A4QN01 128 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 C19orf81C9J6K1 198 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SORBS3O60504 671 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 B4GALT4O60513 344 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 HOXB7P09629 217 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 AKR1A1P14550 325 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PLCG1P19174 1290 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PTGS1P23219 599 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 AFMP43652 599 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 BEX3Q00994 111 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 FYB2Q5VWT5 728 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 G2E3Q7L622 706 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 RPAINQ86UA6 219 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SLC9A7Q96T83 725 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 MRS2Q9HD23 443 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 GRIN2DO15399 1336 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PARP14Q460N5 1801 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CSPG5O95196 566 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 BPNT1O95861 308 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PF4P02776 101 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CYP2C9P11712 490 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ETV3P41162 512 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ERVK-21P61565 698 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PSMC6P62333 389 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 DEFB103AP81534 67 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 LMNB2Q03252 620 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PLS1Q14651 629 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF124Q15973 351 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC24Q50LG9 513 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 KSR1Q8IVT5 923 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 FAM13CQ8NE31 585 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CRELD1Q96HD1 420 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 TINF2Q9BSI4 451 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CTAGE5O15320 804 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01565O15544 149 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 STRNO43815 780 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 CILPO75339 1184 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ACTN1P12814 892 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 GDNFP39905 211 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 BTDP43251 543 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 MLANAQ16655 118 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 MCTP2Q6DN12 878 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 RELL1Q8IUW5 271 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 KIRREL1Q96J84 757 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SLC38A3Q99624 504 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 SPATC1LQ9H0A9 340 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMOD3-210ENST00000561408 R4GN57 208 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms