RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	DLL4	Q9NR61	685 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ASB1	Q9Y576	335 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRB2	O60241	1585 aa		5.83	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SSH2	Q76I76	1423 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	USP32	Q8NFA0	1604 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	IL18BP	O95998	194 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	GUCY2F	P51841	1108 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RALBP1	Q15311	655 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MORC1	Q86VD1	984 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM209	Q96SK2	561 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	INCENP	Q9NQS7	918 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	DCC	P43146	1447 aa		5.82	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TOM1	O60784	492 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ULK1	O75385	1050 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	KATNA1	O75449	491 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PRKD3	O94806	890 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CD40	P25942	277 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R1A	P30153	589 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RAP1GAP	P47736	663 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	HTRA3	P83110	453 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A3	Q01959	620 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	EPHA7	Q15375	998 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	KCNA10	Q16322	511 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL6	Q8N841	843 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CD320	Q9NPF0	282 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MSRA	Q9UJ68	235 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	USP6	P35125	1406 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MYOM1	P52179	1685 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO21	O94952	628 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	APOL3	O95236	402 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN15	O95858	294 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ECE1	P42892	770 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RGS3	P49796	1198 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MTHFS	P49914	203 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00310	P59036	64 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC32	Q14392	662 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PKN1	Q16512	942 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RASSF3	Q86WH2	238 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GTL3	188 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CCER2	I3L3R5	266 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SESN3	P58005	492 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PHC1	P78364	1004 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PDCD1	Q15116	288 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	GPR158	Q5T848	1215 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CNTD1	Q8N815	330 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	WDR48	Q8TAF3	677 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms