RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 CALML4Q96GE6 196 aa23.18■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 SAMD11Q96NU1 681 aa23.18■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.18■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 TRANK1O15050 2925 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 TSPAN1O60635 241 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 SPECC1Q5M775 1068 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.17■■□□□ 1.3
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TMOD3-203ENST00000558455 TMEM192Q8IY95 271 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 KIFAP3Q92845 792 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 CLIC6Q96NY7 704 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 RNF19AQ9NV58 838 aa23.17■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 LPXNO60711 386 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 PLCG1P19174 1290 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 NAMPTP43490 491 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 SLC12A3P55017 1021 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 AMHR2Q16671 573 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 USP49Q70CQ1 688 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC15Q8TF66 581 aa23.16■■□□□ 1.3
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TMOD3-203ENST00000558455 EPSTI1Q96J88 318 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 EYSQ5T1H1 3165 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 HOXA2O43364 376 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 HIP1RO75146 1068 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 EOMESO95936 686 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 PLA2G4BP0C869 781 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 CTNNB1P35222 781 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 RAB27AP51159 221 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 BECN1Q14457 450 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 PPP2R5AQ15172 486 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 STK38Q15208 465 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 DAW1Q8N136 415 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 IFT74Q96LB3 600 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.15■■□□□ 1.3
TMOD3-203ENST00000558455 B4GALT5O43286 388 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 SKIP12755 728 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 GUCY2CP25092 1073 aa23.14■■□□□ 1.29
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TMOD3-203ENST00000558455 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 UBXN11Q5T124 520 aa23.14■■□□□ 1.29
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TMOD3-203ENST00000558455 CPB2Q96IY4 423 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.14■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 AXLP30530 894 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 BMPR1AP36894 532 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.13■■□□□ 1.29
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TMOD3-203ENST00000558455 NOTUMQ6P988 496 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 ABI1Q8IZP0 508 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 LPPQ93052 612 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 DRC1Q96MC2 740 aa23.13■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 CASD1Q96PB1 797 aa23.13■■□□□ 1.29
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TMOD3-203ENST00000558455 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.13■■□□□ 1.29
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TMOD3-203ENST00000558455 HELQQ8TDG4 1101 aa23.12■■□□□ 1.29
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TMOD3-203ENST00000558455 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.12■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 FZD8Q9H461 694 aa23.12■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 KCND2Q9NZV8 630 aa23.12■■□□□ 1.29
TMOD3-203ENST00000558455 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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