RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 UTYO14607 1347 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SH3D21A4FU49 640 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CHKAP35790 457 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 APBA1Q02410 837 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA7Q13683 1181 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CLUL1Q15846 466 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ADALQ6DHV7 355 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR9Q96QG7 549 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CARD6Q9BX69 1037 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZWILCHQ9H900 591 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PARVGQ9HBI0 331 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ESYT2A0FGR8 921 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 S100A6P06703 90 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GYS1P13807 737 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA13P27216 316 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STAT3P40763 770 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CPT1AP50416 773 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 USP4Q13107 963 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CUL1Q13616 776 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 BLIDQ8IZY5 108 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RNF169Q8NCN4 708 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HESX1Q9UBX0 185 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DPYSL4O14531 572 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KCNQ4P56696 695 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STX1BP61266 288 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KRT83P78385 493 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 SESTD1Q86VW0 696 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MROH8Q9H579 483 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CD248Q9HCU0 757 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC151A5D8V7 595 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SULT1B1O43704 296 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TSC22D2O75157 780 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SCG2P13521 617 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 S100A5P33763 92 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 POLA2Q14181 598 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ACAP2Q15057 778 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC24Q50LG9 513 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP7Q8WX94 980 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD7Q9P203 1132 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TNKSO95271 1327 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ATP2A1O14983 1001 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB5O43674 189 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CUTAO60888 179 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM1O75626 825 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FESP07332 822 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB3P29508 390 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PHKA2P46019 1235 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.72□□□□□ -1.33
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