RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ATP4AP20648 1035 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 HOXC8P31273 242 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 LTBRP36941 435 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ADAM17P78536 824 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 COL19A1Q14993 1142 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 GRIK4Q16099 956 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MIER3Q7Z3K6 550 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SERINC5Q86VE9 423 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 HAS1Q92839 578 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 POM121Q96HA1 1249 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 DMDP11532 3685 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 WDR64B1ANS9 1081 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 H3BNC9 293 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 EML1O00423 815 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CSPG5O95196 566 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 AMHP03971 560 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MCM7P33993 719 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZNF174Q15697 407 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MCTP1Q6DN14 999 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RUFY4Q6ZNE9 571 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 FBXL6Q8N531 539 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 HPS1Q92902 700 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 FAM20AQ96MK3 541 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SAMD11Q96NU1 681 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 KIF3AQ9Y496 699 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 H3BQV1 296 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 HBP1O60381 514 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CTSHP09668 335 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RSPH10BP0C881 870 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 KLRC1P26715 233 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SFNP31947 248 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TXKP42681 527 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SLC26A2P50443 739 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 JAK3P52333 1124 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 VCPP55072 806 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RBL2Q08999 1139 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CUL4AQ13619 759 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MBTPS1Q14703 1052 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 UGCGQ16739 394 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TMEM192Q8IY95 271 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 YME1L1Q96TA2 773 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 COL4A6Q14031 1691 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TBX3O15119 743 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZNF862O60290 1169 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NEMFO60524 1076 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TBX10O75333 385 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 HYAL1Q12794 435 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CALCRLQ16602 461 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NCAPH2Q6IBW4 605 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SLFN12Q8IYM2 578 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NRBP2Q9NSY0 501 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 VAV3Q9UKW4 847 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 FAM186AA6NE01 2351 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TMEM150BA6NC51 233 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 H0Y858 1186 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NCK2O43639 380 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 UPP2O95045 317 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CHRNA1P02708 482 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms