RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DPP7Q9UHL4 492 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 VAV3Q9UKW4 847 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.23□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 EML1O00423 815 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SLITRK3O94933 977 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SMTNP53814 917 aa6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 GUCY1B3Q02153 619 aa6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GRB10Q13322 594 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 RNF169Q8NCN4 708 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 DRC1Q96MC2 740 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF623O75123 536 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 RARRES1P49788 294 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLSTN3-215ENST00000544584 SCN5AQ14524 2016 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 LCHNA4D1U4 455 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEMA6NI47 508 aa6.2□□□□□ -1.42
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