RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542233.1

CABP4-205, Transcript of calcium binding protein 4, human

TSL 5

Gene CABP4, Length 353 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CABP4-205	ENST00000542233	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	FGFR4	P22455	802 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	NPTX2	P47972	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	COASY	Q13057	564 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	CUL4B	Q13620	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	SEPT8	Q92599	483 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	CIT	O14578	2027 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	SLC16A4	O15374	487 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	ERLIN2	O94905	339 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	MYL1	P05976	194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	GAP43	P17677	238 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	SMTN	P53814	917 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	EPHB4	P54760	987 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	POSTN	Q15063	836 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	GDF15	Q99988	308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	TTC3	P53804	2025 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CABP4-205	ENST00000542233		H0YCG3	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	GPR182	O15218	404 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TRAK2	O60296	914 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PRKCB	P05771	671 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	ACTN1	P12814	892 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	EFNA5	P52803	228 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TSPAN1	O60635	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	EDN1	P05305	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	DPYD	Q12882	1025 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PNOC	Q13519	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	MAPK6	Q16659	721 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	ANK1	P16157	1881 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CABP4-205	ENST00000542233	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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