RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	NME8	Q8N427	588 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	FAM161B	Q96MY7	647 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ADAM2	Q99965	735 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	HES2	Q9Y543	173 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CAND2	O75155	1236 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MUT	P22033	750 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CASP5	P51878	434 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CUL4B	Q13620	913 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	GIT2	Q14161	759 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SFR1	Q86XK3	245 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TCP11	Q8WWU5	503 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	LPP	Q93052	612 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TISP43	B9A030	160 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	NR1I2	O75469	434 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CSPG5	O95196	566 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CMA1	P23946	247 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SYK	P43405	635 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PTEN	P60484	403 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	KCNA1	Q09470	495 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	IKBKE	Q14164	716 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SEPT8	Q92599	483 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	HPSE	Q9Y251	543 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	FGFR1	P11362	822 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	AMHR2	Q16671	573 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	HERVK_113	Q902F9	699 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477		K7ENM7	598 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TSPAN1	O60635	241 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ERLIN2	O94905	339 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	FAM13A	O94988	1023 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	BMP8B	P34820	402 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	RFC2	P35250	354 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PHKA2	P46019	1235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	KCNJ6	P48051	423 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ASIC1	P78348	528 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477		Q7L0L9	218 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	NAMPT	P43490	491 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	RASIP1	Q5U651	963 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CEP120	Q8N960	986 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	IFT74	Q96LB3	600 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	FIZ1	Q96SL8	496 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MLH1-222	ENST00000539477	ENPP3	O14638	875 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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