RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	TBX4	P57082	545 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ADCY2	Q08462	1091 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CD276	Q5ZPR3	534 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TPH2	Q8IWU9	490 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RELT	Q969Z4	430 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	LRGUK	Q96M69	825 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM94	Q12767	1356 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	KIF15	Q9NS87	1388 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TET3	O43151	1660 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS38	A1L453	326 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CAND2	O75155	1236 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PRL	P01236	227 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	LRG1	P02750	347 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	GLI1	P08151	1106 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	OSM	P13725	252 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MTHFD2	P13995	350 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CYP2C19	P33261	490 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PFKP	Q01813	784 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ODF1	Q14990	250 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MIER2	Q8N344	545 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	INCENP	Q9NQS7	918 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PIK3R4	Q99570	1358 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	FZD9	O00144	591 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA12	O60330	932 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	NCAM1	P13591	858 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RAP1GAP	P47736	663 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RGS3	P49796	1198 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	KRT85	P78386	507 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM240	Q5SV17	173 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	NXN	Q6DKJ4	435 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PPM1N	Q8N819	430 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TEKT5	Q96M29	485 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	FOXB1	Q99853	325 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	USP18	Q9UMW8	372 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	DCC	P43146	1447 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	TRPM2	O94759	1503 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MDM2-223	ENST00000536089	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57

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