RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 CNNM3Q8NE01 707 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 CEP170P1Q96L14 293 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 RAD9AQ99638 391 aa18.67■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.67■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 C22orf31O95567 290 aa18.66■□□□□ 0.58
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PACS1-208ENST00000529677 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.65■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.65■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 KAT6AQ92794 2004 aa18.65■□□□□ 0.58
PACS1-208ENST00000529677 MAGEB2O15479 319 aa18.64■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 C7orf31Q8N865 590 aa18.64■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SETD4Q9NVD3 440 aa18.64■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 GFRA3O60609 400 aa18.63■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 GNAT1P11488 350 aa18.63■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 RBL2Q08999 1139 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 MAPK7Q13164 816 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 MBTPS1Q14703 1052 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 EMC2Q15006 297 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 POSTNQ15063 836 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SPATA20Q8TB22 786 aa18.63■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.63■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 FRMD3A2A2Y4 597 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 ZNF131P52739 623 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 DPYDQ12882 1025 aa18.62■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 RNF135Q8IUD6 432 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 DAW1Q8N136 415 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 DDX12PQ92771 950 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 STAMQ92783 540 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 REEP2Q9BRK0 252 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.62■□□□□ 0.57
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