RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 RFX1P22670 979 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 PHKA2P46019 1235 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 PTH1RQ03431 593 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 TRDNQ13061 729 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 RTKNQ9BST9 563 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 LY9Q9HBG7 655 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 NCDNQ9UBB6 729 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 AKT3Q9Y243 479 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-211ENST00000524095 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 FAM170BA6NMN3 283 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 FAM86B1E9PN63 330 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 TEX28O15482 410 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF623O75123 536 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 EFEMP2O95967 443 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 KIF5BP33176 963 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 GPC3P51654 580 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 FZD5Q13467 585 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 DRP2Q13474 957 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 HTR4Q13639 388 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 PARM1Q6UWI2 310 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CHST12Q9NRB3 414 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CHD6Q8TD26 2715 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CLUHO75153 1309 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 HIP1O00291 1037 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 C2CD2LO14523 706 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 NRP1O14786 923 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 ADAMTS3O15072 1205 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 SPTLC1O15269 473 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 INPPL1O15357 1258 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 LAMTOR5O43504 91 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF862O60290 1169 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 DDAH1O94760 285 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 RXRAP19793 462 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CD72P21854 359 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 TMOD1P28289 359 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 GNAQP50148 359 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 LMNB2Q03252 620 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 LILRA6Q6PI73 481 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 TSSK4Q6SA08 328 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 NCOA7Q8NI08 942 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 STAMQ92783 540 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 FGF14Q92915 247 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 SHDQ96IW2 340 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 GBP3Q9H0R5 595 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 EPC1Q9H2F5 836 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 DACT1Q9NYF0 836 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-211ENST00000524095 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms