RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 UIMC1Q96RL1 719 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 MYL10Q9BUA6 226 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 TOMM22Q9NS69 142 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 FOXN1O15353 648 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 OPHN1O60890 802 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 CFAP100Q494V2 611 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZPA2 131 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 ZNF575Q86XF7 245 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF276Q8N554 614 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 ST8SIA2Q92186 375 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 POFUT1Q9H488 388 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.2□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGCE-211ENST00000522045 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 MRGPREQ86SM8 312 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 OXSMQ9NWU1 459 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 NRP1O14786 923 aa7.18□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.18□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 LENG9Q96B70 501 aa7.18□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PPFIA4O75335 1185 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 RFPL3O75679 317 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 FSTL1Q12841 308 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
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SGCE-211ENST00000522045 SOX7Q9BT81 388 aa7.17□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 GAS7O60861 476 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 STC2O76061 302 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 ASMTLO95671 621 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 GAAP10253 952 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 CD40P25942 277 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGCE-211ENST00000522045 ZMAT4Q9H898 229 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGCE-211ENST00000522045 FZD1Q9UP38 647 aa7.16□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.15□□□□□ -1.26
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SGCE-211ENST00000522045 KIF18BQ86Y91 864 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PASD1Q8IV76 773 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 EFHBQ8N7U6 833 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.15□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 RECQL4O94761 1208 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ALDH1A2O94788 518 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ITGB1P05556 798 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 COL10A1Q03692 680 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 LRRC32Q14392 662 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 MYPNQ86TC9 1320 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 EPC1Q9H2F5 836 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ING3Q9NXR8 418 aa7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGCE-211ENST00000522045 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ABHD16AO95870 558 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 F2P00734 622 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PTPAQ15257 358 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 FERMT2Q96AC1 680 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.13□□□□□ -1.27
SGCE-211ENST00000522045 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.13□□□□□ -1.27
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