RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HCSTQ9UBK5 93 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARNS1A5YM72 827 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POTEMA6NI47 508 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR52Z1P0C646 297 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TECP42680 631 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT17Q04695 432 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFDP1Q14186 410 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC38Q5R3I4 469 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFHBQ8N7U6 833 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HELQQ8TDG4 1101 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGBD4Q96DM1 585 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF558Q96NG5 402 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGFLR1Q9H665 355 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF3AQ9Y496 699 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FSD2A1L4K1 749 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUTP22033 750 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AXLP30530 894 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL2P36404 184 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTENP60484 403 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERMNQ8TAM6 284 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NACC1Q96RE7 527 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPG21Q9NZD8 308 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FSCN2O14926 492 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL9P15248 144 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPA1P27694 616 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCM2P49736 904 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVFC1P60507 584 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNNM3Q8NE01 707 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TLE6Q9H808 572 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MED24O75448 989 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OFD1O75665 1012 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSPG5O95196 566 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRIP1P48552 1158 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDIA5Q14554 519 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMX3Q96JJ7 454 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC01565O15544 149 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERLIN2O94905 339 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCAR1P56945 870 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBXN11Q5T124 520 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJD3Q8N144 294 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPPQ93052 612 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC51Q96ER9 411 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD207Q9UJ71 328 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK24Q9Y6E0 443 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARID2Q68CP9 1835 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WWV3 80 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAD1O00515 517 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBX10O75333 385 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EYA4O95677 639 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLRA2P23416 452 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFV1P49821 464 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAPSQ13938 189 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUSP6Q16828 381 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCF25Q9BQ70 676 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD320Q9NPF0 282 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms