RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511754.5

TNPO1-208, Transcript of transportin 1, human

TSL 5

Gene TNPO1, Length 433 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO1-208	ENST00000511754	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNPO1-208	ENST00000511754	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	OPHN1	O60890	802 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CD40	P25942	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	SPIDR	Q14159	915 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	TCEA2	Q15560	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	HAS1	Q92839	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	MNT	Q99583	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	NRP1	O14786	923 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	MTSS1	O43312	755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	FAM20B	O75063	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	RECQL4	O94761	1208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	PCDH8	O95206	1070 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	F2	P00734	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	RABGGTB	P53611	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	LRRC32	Q14392	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	KPNA6	O60684	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	NRP2	O60462	931 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	GAA	P10253	952 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	SCNN1B	P51168	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	OCRL	Q01968	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNPO1-208	ENST00000511754	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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