RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 RFC5P40937 340 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 GIT2Q14161 759 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 EPHA7Q15375 998 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 LONRF3Q496Y0 759 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TCP11Q8WWU5 503 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 S1PR5Q9H228 398 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ASAP2O43150 1006 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF623O75123 536 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NPEPPSP55786 919 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ZXDAP98168 799 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNC3Q14003 757 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB33Q86T24 672 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 C4orf19Q8IY42 314 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 VPS52Q8N1B4 723 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 URGCPQ8TCY9 931 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 LPPQ93052 612 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 VAV3Q9UKW4 847 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NR2E1Q9Y466 385 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM221A6NGB7 291 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 M0R296 226 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ANAPC15P60006 121 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ITIH3Q06033 890 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 OFD1O75665 1012 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT2P35908 639 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 XKR9Q5GH70 373 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 OXER1Q8TDS5 423 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM143Q96AN5 459 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXL18Q96ME1 805 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 LXNQ9BS40 222 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 GBP3Q9H0R5 595 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 STK39Q9UEW8 545 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TPH2Q8IWU9 490 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 HAS1Q92839 578 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 IGSF21Q96ID5 467 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DYDC2Q96IM9 177 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ERLIN2O94905 339 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH2P05091 517 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 GALTP07902 379 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM29Q14134 588 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEDQ86YR6 584 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF149Q8NC42 400 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CNNM3Q8NE01 707 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MTRQ99707 1265 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RGL1Q9NZL6 768 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CTSAP10619 480 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MTHFRP42898 656 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 AK2P54819 239 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP4A11Q02928 519 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TFDP1Q14186 410 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EMC2Q15006 297 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
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