RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 37.7
PDE4D-215ENST00000506510 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 DAPK3O43293 454 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 D2HGDHQ8N465 521 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 FAM89AQ96GI7 184 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 UIMC1Q96RL1 719 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 TLR9Q9NR96 1032 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 UBE2QL1A1L167 161 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CLSTN1O94985 981 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 FSBPO95073 299 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GAAP10253 952 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PPARAQ07869 468 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GAGE13Q4V321 117 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 RASSF3Q86WH2 238 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 GAB3Q8WWW8 586 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 IL23AQ9NPF7 189 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 NCDNQ9UBB6 729 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-215ENST00000506510 CAPN14A8MX76 684 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ZEB2O60315 1214 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ULK1O75385 1050 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 KIR2DL3P43628 341 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 CD69Q07108 199 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 PDCD1Q15116 288 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 MAN2A1Q16706 1144 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 LY86O95711 162 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 LPLP06858 475 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 CNGA1P29973 690 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 HHEXQ03014 270 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 CT83Q5H943 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 TCF25Q9BQ70 676 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ING3Q9NXR8 418 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 SESN3P58005 492 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 TMPRSS15P98073 1019 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 MGAT5Q09328 741 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 NRN1LQ496H8 165 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 EXTL1Q92935 676 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS50Q9UI38 385 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 NRP2O60462 931 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ALDH1A2O94788 518 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 GPR15P49685 360 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 STAT4Q14765 748 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ARL8AQ96BM9 186 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 VPS11Q9H270 941 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 EDARQ9UNE0 448 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 MTSS1O43312 755 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 BRINP1O60477 761 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 AMHP03971 560 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 ACRV1P26436 265 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-215ENST00000506510 NRG3P56975 720 aa6.48□□□□□ -1.37
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