RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 HOXA2O43364 376 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 ERLIN2O94905 339 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 EYA4O95677 639 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 EOMESO95936 686 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNK18Q7Z418 384 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 CASD1Q96PB1 797 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 PNMA5Q96PV4 448 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 POLD4Q9HCU8 107 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 PRDM6Q9NQX0 595 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 HCSTQ9UBK5 93 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 TSPAN1O60635 241 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 SKIP12755 728 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 LONRF3Q496Y0 759 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 HYIQ5T013 277 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 CABP7Q86V35 215 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 ABI1Q8IZP0 508 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 BSNDQ8WZ55 320 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 LPPQ93052 612 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 AK8Q96MA6 479 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 PLIN2Q99541 437 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 PLVAPQ9BX97 442 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
KCNQ1-205ENST00000496887 GRM6O15303 877 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF623O75123 536 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 RAB27AP51159 221 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIN1Q05586 938 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 AMHR2Q16671 573 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPROQ16827 1216 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 UBXN11Q5T124 520 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 HELQQ8TDG4 1101 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CPB2Q96IY4 423 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CWH43Q9H720 699 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 AXLP30530 894 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 UBA7P41226 1012 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPAQ15257 358 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 P2RX5Q93086 422 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 B4GALT5O43286 388 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 RINT1Q6NUQ1 792 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 NOTUMQ6P988 496 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC43Q8N309 656 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 KIFAP3Q92845 792 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PGBD4Q96DM1 585 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 AAASQ9NRG9 546 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 MYH11P35749 1972 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 ITGB1P05556 798 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 NAMPTP43490 491 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP2R5AQ15172 486 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC51Q96ER9 411 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CALML4Q96GE6 196 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 IFT74Q96LB3 600 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 FZD8Q9H461 694 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC26A4O43511 780 aa18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 HIP1RO75146 1068 aa18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 CSPG5O95196 566 aa18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1-205ENST00000496887 PLA2G4BP0C869 781 aa18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms