RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF558Q96NG5 402 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-207ENST00000492954 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-207ENST00000492954 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TBX10O75333 385 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 MED24O75448 989 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TMX3Q96JJ7 454 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TLR9Q9NR96 1032 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 ARID2Q68CP9 1835 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 SKIP12755 728 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 NRIP1P48552 1158 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TRAPPC10P48553 1259 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 RAB27AP51159 221 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 CLUL1Q15846 466 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 ARL2P36404 184 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 ERVFC1P60507 584 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 PLCB3Q01970 1234 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 ADAM15Q13444 863 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 CAPSQ13938 189 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 POTEGQ6S5H5 508 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 PPM1AP35813 382 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 NDUFV1P49821 464 aa20.04■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 UBXN11Q5T124 520 aa20.04■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.04■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 PER2O15055 1255 aa20.03■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.03■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 ERMNQ8TAM6 284 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 PGBD4Q96DM1 585 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 NACC1Q96RE7 527 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TSPAN1O60635 241 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 BCAR1P56945 870 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 KRT17Q04695 432 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTPRU-207ENST00000492954 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 CPB2Q96IY4 423 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TCF25Q9BQ70 676 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 CLEC1BQ9P126 229 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 CD207Q9UJ71 328 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 FAM50BQ9Y247 325 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-207ENST00000492954 MBTPS2O43462 519 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-207ENST00000492954 GJB2P29033 226 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-207ENST00000492954 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
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