RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIGS	Q96S52	555 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC9A7	Q96T83	725 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CABP5	Q9NP86	173 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM75P	A6NK02	468 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLITRK5	O94991	958 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	VCAM1	P19320	739 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGCS2	P54868	508 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BACE1	P56817	501 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	REST	Q13127	1097 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB33A	Q14088	237 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TREML2	Q5T2D2	321 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAOX	Q6QHF9	649 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	REPS2	Q8NFH8	660 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf42	Q96LP6	360 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF536	O15090	1300 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK36	Q9NRP7	1315 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM232	C9JQI7	657 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	STXBP3	O00186	592 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBOX5	O94941	541 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALM1	P0DP23	149 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALM2	P0DP24	149 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALM3	P0DP25	149 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAG1	P15918	1043 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC1A4	P43007	532 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT40	Q6A162	431 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF4	Q8WV16	495 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D5	Q92609	795 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPN18	Q99952	460 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALG1	Q9BT22	464 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMX2	A2RU54	273 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	STX6	O43752	255 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLA2G6	O60733	806 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNMD	O75829	334 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMARCA1	P28370	1054 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPAT	Q06203	517 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC96	Q2M329	555 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FERMT3	Q86UX7	667 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERO1B	Q86YB8	467 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	COA7	Q96BR5	231 aa		7.06	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms