RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	GPR158	Q5T848	1215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	SCYL1	Q96KG9	808 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	OR14A2	Q96R54	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	FOXB1	Q99853	325 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	IFT22	Q9H7X7	185 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	INCENP	Q9NQS7	918 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	GALNT8	Q9NY28	637 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	NR2E1	Q9Y466	385 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	LCHN	A4D1U4	455 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	GPR39	O43194	453 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PEX11B	O96011	259 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PRL	P01236	227 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PTMS	P20962	102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	IL13RA1	P78552	427 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	MYBPC3	Q14896	1274 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF174	Q15697	407 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	BTBD2	Q9BX70	525 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	BRINP1	O60477	761 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RAB11FIP3	O75154	756 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	CD38	P28907	300 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ECE1	P42892	770 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ETV4	P43268	484 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	IL2	P60568	153 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PTPRO	Q16827	1216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	BROX	Q5VW32	411 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	SLC5A5	Q92911	643 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	USP7	Q93009	1102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	MAML3	Q96JK9	1138 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	TTC1	Q99614	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	OR10A5	Q9H207	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	VTA1	Q9NP79	307 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	TOMM22	Q9NS69	142 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444		K7ESF4	209 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ARHGAP6	O43182	974 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RHOBTB3	O94955	611 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	HMGCR	P04035	888 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PROZ	P22891	400 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	RGS3	P49796	1198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	CD83	Q01151	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	OCRL	Q01968	901 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	HHEX	Q03014	270 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	PDCD1	Q15116	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	HIPK4	Q8NE63	616 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	WDR48	Q8TAF3	677 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PUM3-204	ENST00000490444	MSL2	Q9HCI7	577 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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