RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.38□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 OPHN1O60890 802 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 TRIM27P14373 513 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PPARAQ07869 468 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 DTX3Q8N9I9 347 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 FBXO41Q8TF61 875 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 TSPEARQ8WU66 669 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 GAB3Q8WWW8 586 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 HPS3Q969F9 1004 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 COA7Q96BR5 231 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 RUNDC1Q96C34 613 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MAP3K14Q99558 947 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SARGQ9BW04 601 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.37□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 A0A0A6YYJ9 748 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 NRP2O60462 931 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 DTNBO60941 627 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CYP2C8P10632 490 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PDCP20941 246 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 GRM3Q14832 879 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 BRD3Q15059 726 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 TIFAQ96CG3 184 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 TAAR9Q96RI9 348 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.36□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CUTAO60888 179 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MAP3K12Q12852 859 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 STILQ15468 1287 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 USP45Q70EL2 814 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SP8Q8IXZ3 490 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 SYT8Q8NBV8 401 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MORC4Q8TE76 937 aa7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 C8BP07358 591 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PFKLP17858 780 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 FBLN1P23142 703 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 THBS2P35442 1172 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 GLRBP48167 497 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 NRG3P56975 720 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MALLQ13021 153 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PJA1Q8NG27 643 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PWWP2AQ96N64 755 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 WRNIP1Q96S55 665 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 WASF3Q9UPY6 502 aa7.34□□□□□ -1.23
CUL3-211ENST00000487558 PHKG2P15735 406 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PICALMQ13492 652 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ADRM1Q16186 407 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 DGKDQ16760 1214 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 GORABQ5T7V8 394 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.33□□□□□ -1.24
CUL3-211ENST00000487558 PRR18Q8N4B5 295 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms