RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487284.2

CUX1-209, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-209ENST00000487284 K7ENM7 598 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 STX10O60499 249 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 DGAT1O75907 488 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CCL5P13501 91 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CASP14P31944 242 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 NCKAP1LP55160 1127 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CHMP4BP1P59074 171 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SYCP1Q15431 976 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 RETREG2Q8NC44 543 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CEP89Q96ST8 783 aa15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 HBP1O60381 514 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PSEN2P49810 448 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 RTP1P59025 263 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 FIGNQ5HY92 759 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 KIFAP3Q92845 792 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 IQCDQ96DY2 449 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ZNF333Q96JL9 665 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 DEFB118Q96PH6 123 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 NUP58Q9BVL2 599 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 GBP3Q9H0R5 595 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 RNF208Q9H0X6 261 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.56■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 HAS3O00219 553 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ARHGAP6O43182 974 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 KPNA6O60684 536 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ASGR1P07306 291 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 INSRRP14616 1297 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 GTF2BQ00403 316 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 MFSD10Q14728 455 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 KCNA10Q16322 511 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 FAM102BQ5T8I3 360 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 RNF180Q86T96 592 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 HVCN1Q96D96 273 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 EVPLQ92817 2033 aa15.55■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ZEB2O60315 1214 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 OFD1O75665 1012 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PEX3P56589 373 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SOX10P56693 466 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 IGBP1P78318 339 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 MYBPC2Q14324 1141 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 EMC2Q15006 297 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 KSR1Q8IVT5 923 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ARMC5Q96C12 935 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 TMEM206Q9H813 350 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 DMAC2Q9NW81 257 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 TTC26A0AVF1 554 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 AKAP3O75969 853 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 PPFIA1Q13136 1202 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ZBTB10Q96DT7 871 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 ACCSQ96QU6 501 aa15.53■□□□□ 0.08
CUX1-209ENST00000487284 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms