RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 43.6
RAD51B-210ENST00000487270 ALG3Q92685 438 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SLC5A5Q92911 643 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 COG5Q9UP83 839 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC172P0C7W6 258 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 KRT13P13646 458 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 BAG6P46379 1132 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 PPATQ06203 517 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 IFT88Q13099 833 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 DAW1Q8N136 415 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 KAT2BQ92831 832 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ACP6Q9NPH0 428 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 DMAC2Q9NW81 257 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SNX24Q9Y343 169 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ALG6Q9Y672 507 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 UTRNP46939 3433 aa7.18□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 TLDC2A0PJX2 215 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ANKRD62A6NC57 917 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SMIM23A6NLE4 172 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 H0YHG0 523 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 H0YIN7 160 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ENTPD3O75355 529 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 BCRP11274 1271 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 PLTPP55058 493 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 DR1Q01658 176 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 PPP3CAQ08209 521 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MTMR3Q13615 1198 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MESDQ14696 234 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 PADI6Q6TGC4 694 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 LDHDQ86WU2 507 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 KAT5Q92993 513 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 AKT1S1Q96B36 256 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 FMO2Q99518 471 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 AGPAT1Q99943 283 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 VEZTQ9HBM0 779 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 TMX2Q9Y320 296 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 FOCADQ5VW36 1801 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM150BA6NC51 233 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ITGB5P18084 799 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MARCKSL1P49006 195 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF131P52739 623 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 PPP2R5AQ15172 486 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 EMC10Q5UCC4 262 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 LMO3Q8TAP4 145 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 KRT35Q92764 455 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 C18orf8Q96DM3 657 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SYT11Q9BT88 431 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 GMNCA6NCL1 334 aa7.16□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 PPIP5K2O43314 1243 aa7.16□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 RAD17O75943 681 aa7.16□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 SGPL1O95470 568 aa7.16□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 FAM107AO95990 144 aa7.16□□□□□ -1.26
RAD51B-210ENST00000487270 GUCY2CP25092 1073 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms