RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485067.1

USP16-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 16, humanhuman

TSL 2

Gene USP16, Length 2,259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16-206ENST00000485067 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 COASYQ13057 564 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 HAUS3Q68CZ6 603 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 HELQQ8TDG4 1101 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 GMCL1Q96IK5 515 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CCDC42Q96M95 316 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 NUDT12Q9BQG2 462 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 PANK4Q9NVE7 773 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CROTQ9UKG9 612 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 STAM2O75886 525 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 LCA5LO95447 670 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ABL1P00519 1130 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CYP1A2P05177 515 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 VAV2P52735 878 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 KIF5AQ12840 1032 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 KCNK18Q7Z418 384 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 APPL2Q8NEU8 664 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 WHAMMQ8TF30 809 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 AMNQ9BXJ7 453 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ANO3Q9BYT9 981 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 STK32BQ9NY57 414 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L15C9J2P7 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L11C9JVI0 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L18D6R9N7 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L22D6RA61 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L19D6RCP7 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L20D6RJB6 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 AHCYL1O43865 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ENTPD3O75355 529 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ATG7O95352 703 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 KLK7P49862 253 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L24Q0WX57 530 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 UCN2Q96RP3 112 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 IER2Q9BTL4 223 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 FAM107BQ9H098 131 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 EPC1Q9H2F5 836 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 VCX3BQ9H321 246 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SYNCQ9H7C4 482 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.99□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 A0A0B4J203 849 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 PLA2G4BP0C869 781 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 DPEP1P16444 411 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 KCNA3P22001 575 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ACTN2P35609 894 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SCNN1BP51168 640 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ARPC4P59998 168 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 TAF11Q15544 211 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ECM1Q16610 540 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 HDXQ7Z353 690 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 CNKSR1Q969H4 720 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 FAM20AQ96MK3 541 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.815e-6■■■□□ 16.3
USP16-206ENST00000485067 FUT8Q9BYC5 575 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 A0A1W2PRG0 241 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 TMEM221A6NGB7 291 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 MAP2K7O14733 419 aa9.98□□□□□ -0.81
USP16-206ENST00000485067 MEIS2O14770 477 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms