RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	GNAT2	P19087	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	KIF11	P52732	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SPIDR	Q14159	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	DVL2	O14641	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PLD2	O14939	933 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	FNTB	P49356	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	NPEPPS	P55786	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	LPXN	O60711	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF460	Q14592	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	DAPK3	O43293	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	OPA1	O60313	960 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	NPTXR	O95502	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CFB	P00751	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SDS	P20132	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM189B	P81408	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	RECQL4	O94761	1208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	LAG3	P18627	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	IGFALS	P35858	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173		Q6YL49	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173		B4E1Z4	1266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	TRIM24	O15164	1050 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ASMTL	O95671	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	GYPE	P15421	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ASL	P04424	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	JMJD7	P0C870	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	CD38	P28907	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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