RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A087WZ62 844 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMAPO00193 183 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZBTB39O15060 712 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DGKIO75912 1065 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RB1P06400 928 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DRP2Q13474 957 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TFDP1Q14186 410 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DSC3Q14574 896 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EMC2Q15006 297 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FERMT3Q86UX7 667 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FIBCD1Q8N539 461 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YME1L1Q96TA2 773 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAM2Q99965 735 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNM3Q9UQ16 869 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01553A4QN01 128 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C9IYK1 514 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HOXA2O43364 376 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STX6O43752 255 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EOMESO95936 686 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SKIP12755 728 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOSL2P15408 326 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYP11B2P19099 503 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARL2P36404 184 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHKA2P46019 1235 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IL17AQ16552 155 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HYIQ5T013 277 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYLIPQ8WY64 445 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM143Q96AN5 459 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTMR6Q9Y217 621 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COL4A6Q14031 1691 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SZT2Q5T011 3432 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYO9BQ13459 2157 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SIP14410 1827 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A0U1RQF3 1178 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LCHNA4D1U4 455 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MGEA5O60502 916 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF623O75123 536 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EYA4O95677 639 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AXLP30530 894 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTENP60484 403 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RESTQ13127 1097 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KSR1Q8IVT5 923 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF149Q8NC42 400 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIFAP3Q92845 792 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLRP4Q96MN2 994 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIPINQ9BVW5 301 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCND2Q9NZV8 630 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.03□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GBF1Q92538 1859 aa9.02□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTPRSQ13332 1948 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CARNS1A5YM72 827 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GLRA2P23416 452 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BMPR1AP36894 532 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBA7P41226 1012 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB27AP51159 221 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP2R5AQ15172 486 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ECM1Q16610 540 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPC2Q52LR7 807 aa9.02□□□□□ -0.97
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms