RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RPTORQ8N122 1335 aa16.13■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.12■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.12■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 PDE6BP35913 854 aa16.12■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 CASP4P49662 377 aa16.12■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 29.9
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TOP3B-206ENST00000436282 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.12■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 ASTN1O14525 1302 aa16.11■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 PHF2O75151 1096 aa16.11■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 ABCB4P21439 1286 aa16.11■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 STAT3P40763 770 aa16.11■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 PDE6CP51160 858 aa16.11■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 SYT11Q9BT88 431 aa16.11■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 UBOX5O94941 541 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 ANP32DO95626 131 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 CHRNA3P32297 505 aa16.1■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 SLMAPQ14BN4 828 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.1■□□□□ 0.17
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TOP3B-206ENST00000436282 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 RARAP10276 462 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 IFNAR2P48551 515 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF131P52739 623 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 AGAP11Q8TF27 550 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 ALG3Q92685 438 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 C18orf8Q96DM3 657 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.1■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 APBA3O96018 575 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 PODNQ7Z5L7 613 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOP3B-206ENST00000436282 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.09■□□□□ 0.17
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