RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434451.1

TNS3-205, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TNS3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-205ENST00000434451 RNF169Q8NCN4 708 aa18.51■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ERMNQ8TAM6 284 aa18.51■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ZNF558Q96NG5 402 aa18.51■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 HCSTQ9UBK5 93 aa18.51■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 IRS1P35568 1242 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MCM2P49736 904 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TFDP1Q14186 410 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 RNF149Q8NC42 400 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 HELQQ8TDG4 1101 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 FSCN2O14926 492 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MUTP22033 750 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ARL2P36404 184 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 LTBRP36941 435 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 PTENP60484 403 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 EFHBQ8N7U6 833 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 PGBD4Q96DM1 585 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CCDC51Q96ER9 411 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TBX10O75333 385 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ERLIN2O94905 339 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 RPA1P27694 616 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 AXLP30530 894 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TECP42680 631 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ADAM15Q13444 863 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ZNF174Q15697 407 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TMX3Q96JJ7 454 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 NACC1Q96RE7 527 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 SPG21Q9NZD8 308 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 STK24Q9Y6E0 443 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 LAD1O00515 517 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MED24O75448 989 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CSPG5O95196 566 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 IL9P15248 144 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 KRT17Q04695 432 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CAPSQ13938 189 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 CNNM3Q8NE01 707 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TSPAN1O60635 241 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 GLRA2P23416 452 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.1
TNS3-205ENST00000434451 NRIP1P48552 1158 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 UBXN11Q5T124 520 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 NOTUMQ6P988 496 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 RAB34Q9BZG1 259 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 IGFLR1Q9H665 355 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS3-205ENST00000434451 LINC01565O15544 149 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 OFD1O75665 1012 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 NDUFV1P49821 464 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 BCAR1P56945 870 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 ERVFC1P60507 584 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 PDIA5Q14554 519 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 DUSP6Q16828 381 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 POTEGQ6S5H5 508 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 URGCPQ8TCY9 931 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 LPPQ93052 612 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 TLE6Q9H808 572 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS3-205ENST00000434451 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms