RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429844.2

RPSAP8-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP8, Length 889 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP8-201ENST00000429844 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 DGKIO75912 1065 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 EDN1P05305 212 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 LINC00271P0C7V0 271 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 GUCY2CP25092 1073 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 GATMP50440 423 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 MCM6Q14566 821 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ODR4Q5SWX8 454 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ATL3Q6DD88 541 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 SHC4Q6S5L8 630 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 RAD54LQ92698 747 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 CALML4Q96GE6 196 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 GUCD1Q96NT3 240 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RPSAP8-201ENST00000429844 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 A0A0U1RQF3 1178 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 DENND3A2RUS2 1198 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 LINC01553A4QN01 128 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 SFI1A8K8P3 1242 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 B4GALT5O43286 388 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 TSPAN1O60635 241 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 HIP1RO75146 1068 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PHKA2P46019 1235 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 TFDP1Q14186 410 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 GRIN2CQ14957 1233 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 KIFAP3Q92845 792 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PANK2Q9BZ23 570 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 FZD8Q9H461 694 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CHST12Q9NRB3 414 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 RNF19AQ9NV58 838 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CFAP45Q9UL16 551 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 INSL6Q9Y581 213 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 EPOPA6NHQ4 379 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CUTAO60888 179 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 NAMPTP43490 491 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PEX3P56589 373 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 UBXN11Q5T124 520 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CPB2Q96IY4 423 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 YME1L1Q96TA2 773 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 REEP2Q9BRK0 252 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CERS4Q9HA82 394 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 USP20Q9Y2K6 914 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 MYMKA6NI61 221 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP8-201ENST00000429844 RFXAPO00287 272 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms