RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BICD1Q96G01 975 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSG101Q99816 390 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPY26PQ9H489 355 aa11.3□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYH11P35749 1972 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BICDL2A1A5D9 508 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DENND3A2RUS2 1198 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 THPOP40225 353 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCKAP1LP55160 1127 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAM17P78536 824 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BFSP2Q13515 415 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAPSQ13938 189 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAGE1Q8TC20 777 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACCSQ96QU6 501 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM206Q9H813 350 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POLD4Q9HCU8 107 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GINS2Q9Y248 185 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDAQ9Y2T3 454 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRIN2DO15399 1336 aa11.29□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CENPFP49454 3210 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7ERI5 159 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B4GALT4O60513 344 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ERLIN2O94905 339 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPC3P51654 580 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF445P59923 1031 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPM4P67936 248 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POU5F1BQ06416 359 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EHHADHQ08426 723 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK4Q13043 487 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAK1Q13153 545 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DRP2Q13474 957 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAPK6Q16659 721 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIZQ2M2Z5 673 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BSNDQ8WZ55 320 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NFKBIZQ9BYH8 718 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.28□□□□□ -0.6
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WZ62 844 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BECN2A8MW95 431 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRKCBP05771 671 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTSHP09668 335 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYBP10242 640 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL6A1P12109 1028 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTENP60484 403 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM60Q495X7 471 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPAINQ86UA6 219 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.27□□□□□ -0.61
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms