RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428525.1

AC008065.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC008065.1, Length 348 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008065.1-201ENST00000428525 NT5C1BQ96P26 610 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MDFIQ99750 246 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 FOXQ1Q9C009 403 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CDIP1Q9H305 208 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 BRD9Q9H8M2 597 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa4.86□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 IRAK2O43187 625 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PLA2G6O60733 806 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 LRIG2O94898 1065 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 INMTO95050 263 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 AMY2AP04746 511 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 AMY2BP19961 511 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CD40P25942 277 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CNTFP26441 200 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ALDH9A1P49189 494 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 TUBP50607 506 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 KIF11P52732 1056 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SLC5A3P53794 718 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 JAM2P57087 298 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 NLRP12P59046 1061 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 DCAF7P61962 342 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 KRT83P78385 493 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 POU4F1Q01851 419 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SCARF1Q14162 830 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SEPT2Q15019 361 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MEA1Q16626 185 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PFKFB4Q16877 469 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ISL2Q96A47 359 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PTPN18Q99952 460 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SP110Q9HB58 689 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CLEC1BQ9P126 229 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 EDARQ9UNE0 448 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 FMN1Q68DA7 1419 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MBD5Q9P267 1494 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MYOM1P52179 1685 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 RGPD1P0DJD0 1748 aa4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MYOM2P54296 1465 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CCNB3Q8WWL7 1395 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 USP19O94966 1318 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 A0A088AWK7 358 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 FSD2A1L4K1 749 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CCDC154A6NI56 674 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 TNFRSF10AO00220 468 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ACKR2O00590 384 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SIGLEC6O43699 453 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ZBTB7AO95365 584 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 CD3EP07766 207 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MTHFD2P13995 350 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 HOXC13P31276 330 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MAN2A2P49641 1150 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 ITGA8P53708 1063 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 SLC16A1P53985 500 aa4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC008065.1-201ENST00000428525 GRM1Q13255 1194 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms