RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SRGAP2O75044 1071 aa25.28■■□□□ 1.64
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FAAP20-209ENST00000428120 GCLMP48507 274 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 JAM2P57087 298 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 PPP3CAQ08209 521 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD2Q14681 263 aa25.28■■□□□ 1.64
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FAAP20-209ENST00000428120 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.28■■□□□ 1.64
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FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.28■■□□□ 1.64
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FAAP20-209ENST00000428120 CHMP4BP1P59074 171 aa25.27■■□□□ 1.64
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FAAP20-209ENST00000428120 PCYT2Q99447 389 aa25.27■■□□□ 1.64
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FAAP20-209ENST00000428120 ARIH2O95376 493 aa25.26■■□□□ 1.63
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FAAP20-209ENST00000428120 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 GFPT2O94808 682 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.26■■□□□ 1.63
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FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 USP20Q9Y2K6 914 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 MCM3APO60318 1980 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SOCS7O14512 581 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 BUB1O43683 1085 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 PORCNQ9H237 461 aa25.25■■□□□ 1.63
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FAAP20-209ENST00000428120 PJA2O43164 708 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 CEP112Q8N8E3 955 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA1Q92805 767 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 IFT74Q96LB3 600 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ERVK-9P63128 1117 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 NEDD9Q14511 834 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM58Q8NG06 486 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 EFCC1Q9HA90 598 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SAR1BQ9Y6B6 198 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SCN4AP35499 1836 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.24■■□□□ 1.63
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FAAP20-209ENST00000428120 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 F8VZ95 297 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 LMO3Q8TAP4 145 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 HVCN1Q96D96 273 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 BICD1Q96G01 975 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 STAT5BP51692 787 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 METTL7BQ6UX53 244 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 EVI5O60447 810 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TGFB3P10600 412 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 STAT1P42224 750 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM50Q86XT4 487 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 STK33Q9BYT3 514 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 GPR88Q9GZN0 384 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF185O15231 689 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 MARK3P27448 753 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 PRKCIP41743 596 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 RTP1P59025 263 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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