RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 RASSF9O75901 435 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 TMOD1P28289 359 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 JAM2P57087 298 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 KCNA1Q09470 495 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 NT5DC3Q86UY8 548 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 AKAP3O75969 853 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 NR3C1P04150 777 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 SIX2Q9NPC8 291 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 FAM114A2Q9NRY5 505 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF536O15090 1300 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 C5orf60A6NFR6 353 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TTI1O43156 1089 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 FAM13AO94988 1023 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 ICAM1P05362 532 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 DAAM2Q86T65 1068 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 HES6Q96HZ4 224 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 KLC4Q9NSK0 619 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MUTP22033 750 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 HSD17B4P51659 736 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 RASA3Q14644 834 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MYCT1Q8N699 235 aa26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.842e-8■■■■□ 23.1
FAAP20-206ENST00000414253 QPCTQ16769 361 aa26.56■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.56■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.56■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 NACC1Q96RE7 527 aa26.56■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MTFR1LQ9H019 292 aa26.56■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 F8VZ95 297 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CASP4P49662 377 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 RAPGEF5Q92565 580 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CLIC2O15247 247 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TGFB1I1O43294 461 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TCERG1LQ5VWI1 586 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 SEC16BQ96JE7 1060 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 PARVGQ9HBI0 331 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 SLC40A1Q9NP59 571 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 NFKBIEO00221 500 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CHUKO15111 745 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 KRT71Q3SY84 523 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 GCNT4Q9P109 453 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 COL20A1Q9P218 1284 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 AMFRQ9UKV5 643 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 FERP16591 822 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 ITGB5P18084 799 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 PPARDQ03181 441 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 SPDYCQ5MJ68 293 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 SLC35C1Q96A29 364 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC114Q96M63 670 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 NFIBO00712 420 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 HOOK2Q96ED9 719 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TEPSINQ96N21 525 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 RIT2Q99578 217 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 DPH5Q9H2P9 285 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 DCDC2CA8MYV0 355 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 GFPT2O94808 682 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 MAP2K2P36507 400 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 GALCP54803 685 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 TATDN2Q93075 761 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-206ENST00000414253 FIZ1Q96SL8 496 aa26.53■■□□□ 1.84
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