RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 CYP2J2P51589 502 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 STRN3Q13033 797 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 BICD1Q96G01 975 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SETD4Q9NVD3 440 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TEX33O43247 280 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ZEB2O60315 1214 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TMOD1P28289 359 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TFDP1Q14186 410 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 TISP43B9A030 160 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 K7ERI5 159 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 KPNA6O60684 536 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 C1QTNF8P60827 252 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 UBXN1Q04323 297 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 NFIL3Q16649 462 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 VSTM4Q8IW00 320 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 RNF149Q8NC42 400 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 NLRP4Q96MN2 994 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 AKT3Q9Y243 479 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 NRCAMQ92823 1304 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 INHAP05111 366 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 GJB1P08034 283 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 SCP2P22307 547 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MAN2A1Q16706 1144 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-204ENST00000402096 LGALS16A8MUM7 142 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 HAS3O00219 553 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 ASAP2O43150 1006 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 GRK4P32298 578 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 CASP4P49662 377 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MAP7D2Q96T17 732 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 EXOC3O60645 756 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 AKAP3O75969 853 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 LIG4P49917 911 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 C7orf31Q8N865 590 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 ADAMTS4O75173 837 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 EFNA5P52803 228 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 VWA3BQ502W6 1294 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MIIPQ5JXC2 388 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 VTNP04004 478 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MYBPC2Q14324 1141 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SCLT1Q96NL6 688 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 DMAC2Q9NW81 257 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 RDH13Q8NBN7 331 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 NDST4Q9H3R1 872 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 WBP1LQ9NX94 342 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 USP20Q9Y2K6 914 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.41■■□□□ 1.18
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