RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.46□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 KRT14P02533 472 aa9.46□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 PAMP19021 973 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC12A1Q13621 1099 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-202ENST00000400053 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-202ENST00000400053 FSCBQ5H9T9 825 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-202ENST00000400053 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.44□□□□□ -0.9
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