RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT38O76015 456 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 GPC3P51654 580 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TXNRD1Q16881 649 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 PASD1Q8IV76 773 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 CYTH2Q99418 400 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TFDP2Q14188 446 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM260Q9NX78 707 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF394Q53GI3 561 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 NRBF2Q96F24 287 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SPATA17Q96L03 361 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ADRA2BP18089 450 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FSCBQ5H9T9 825 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 DONSONQ9NYP3 566 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ALX1Q15699 326 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 GIPC2Q8TF65 315 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SPATA33Q96N06 139 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 MYO1CO00159 1063 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF19Q2TAC6 998 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 IFT43Q96FT9 208 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 VPS39Q96JC1 886 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 BARHL2Q9NY43 387 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 DEUP1Q05D60 604 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 YAF2Q8IY57 180 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 POTEB3A0JP26 581 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 GMNCA6NCL1 334 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 POTECB2RU33 542 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 POTEBQ6S5H4 581 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 CHRNA3P32297 505 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 VAMP7P51809 220 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF699Q32M78 642 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SEMA3FQ13275 785 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 UTYO14607 1347 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM270Q6UE05 265 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ITM2BQ9Y287 266 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TEX33O43247 280 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 PRDX5P30044 214 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC31Q6UY01 552 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TET3O43151 1660 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L15C9J2P7 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L11C9JVI0 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L18D6R9N7 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L22D6RA61 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L19D6RCP7 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L20D6RJB6 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L24Q0WX57 530 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 MORC4Q8TE76 937 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 UBE4BO95155 1302 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 PLA2R1Q13018 1463 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 KPNA7A9QM74 516 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC16A4O15374 487 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 E2F4Q16254 413 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SPON1Q9HCB6 807 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC26A0AVF1 554 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 MYBL1P10243 752 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1W2PQC6 194 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SHC4Q6S5L8 630 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 CPVLQ9H3G5 476 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM187AA6NFU0 413 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF28PB7ZC32 967 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ACCSLQ4AC99 568 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28-201ENST00000399451 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms