RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 GAS7O60861 476 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 CNMDO75829 334 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 STAM2O75886 525 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 PSMC6P62333 389 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 UBXN2AP68543 259 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC63Q05C16 580 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 LRMPQ12912 555 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 COASYQ13057 564 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 GIT2Q14161 759 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KRT31Q15323 416 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TREML2Q5T2D2 321 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TMC6Q7Z403 805 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 GPBP1Q86WP2 473 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 DRC7Q8IY82 874 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 RDM1Q8NG50 284 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 GPRASP2Q96D09 838 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 IWS1Q96ST2 819 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 RMDN3Q96TC7 470 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ACAD9Q9H845 621 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KCND2Q9NZV8 630 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PQC6 194 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KCNJ18B7U540 433 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TEX33O43247 280 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 OFD1O75665 1012 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 EDNRBP24530 442 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 CCND2P30279 289 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ICAM3P32942 547 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 COPB2P35606 906 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF131P52739 623 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 FKBP1BP68106 108 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 NR1H3Q13133 447 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.341e-16■■■■■ 30.8
C6orf48-208ENST00000395788 MTMR1Q13613 665 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 PRKG1Q13976 671 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KCNJ12Q14500 433 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.347e-18■■■■□ 24.9
C6orf48-208ENST00000395788 GPR162Q16538 588 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 DYMQ7RTS9 669 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM139Q8IV31 216 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 DNERQ8NFT8 737 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 HPS3Q969F9 1004 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 DYDC2Q96IM9 177 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 UIMC1Q96RL1 719 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ELP3Q9H9T3 547 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 PANK4Q9NVE7 773 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 RGL1Q9NZL6 768 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 BTBD7Q9P203 1132 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO40Q9UH90 709 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 NFASCO94856 1347 aa6.67□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 LGALS16A8MUM7 142 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ATP9AO75110 1047 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KIF20AO95235 890 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 KCNA2P16389 499 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 GAP43P17677 238 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 FSTP19883 344 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 GUCY2CP25092 1073 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 SFNP31947 248 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 JAK3P52333 1124 aa6.66□□□□□ -1.34
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