RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB34Q9BZG1 259 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LAG3P18627 525 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 GLRA2P23416 452 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJB1P25685 340 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB27AP51159 221 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CUL4AQ13619 759 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPSQ13938 189 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PDIA5Q14554 519 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LONRF3Q496Y0 759 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 POF1BQ8WVV4 589 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LPPQ93052 612 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ERLIN2O94905 339 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 BMP1P13497 986 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MUTP22033 750 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPHP41219 470 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 POU5F1BQ06416 359 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 IL17AQ16552 155 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ECM1Q16610 540 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PADI6Q6TGC4 694 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0C4DFX4 3053 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF623O75123 536 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF18O76093 207 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 STK24Q9Y6E0 443 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PP2D1A8MPX8 630 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPAN1O60635 241 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNA5P22460 613 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 IRS1P35568 1242 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 UBXN11Q5T124 520 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP11B2P19099 503 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PBX3P40426 434 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE3AQ05086 875 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 HYAL1Q12794 435 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT79Q5XKE5 535 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PGBD4Q96DM1 585 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF558Q96NG5 402 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC25AP30304 524 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 AXLP30530 894 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 COL19A1Q14993 1142 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NOTUMQ6P988 496 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CPB2Q96IY4 423 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDND1Q9NY35 253 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NCK2O43639 380 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 OFD1O75665 1012 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 AMHR2Q16671 573 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 BSNDQ8WZ55 320 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 IGFLR1Q9H665 355 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR9Q9NR96 1032 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCP20941 246 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PPM1AP35813 382 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCB3Q01970 1234 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD39-201ENST00000393537 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms